Dzięki programowi „Inicjatywa Doskonałości – Uczelnia Badawcza” na Politechnice Gdańskiej zostały utworzone cztery centra naukowe: Centrum BioTechMed, Centrum EkoTech, Centrum Technologii Cyfrowych oraz Centrum Materiałów Przyszłości.
Politechnika Gdańska, w ramach współpracy z otoczeniem społeczno-gospodarczym, powołała także cztery ogólnouczelniane, interdyscyplinarne centra badawczo-wdrożeniowe: Centrum Morskiej Energetyki Wiatrowej, Centrum Technologii Wodorowych, Centrum Energetyki Jądrowej oraz Centrum Technologii Bezpieczeństwa i Obronności .
