Stowarzyszenie Muzeów Uczelnianych powstało z inicjatywy środowiska muzealników akademickich, którego współpraca rozpoczęła się w 2012 roku. Pierwsze spotkania przedstawicieli muzeów uczelnianych doprowadziły do powołania projektu "Muzea Uczelniane", a następnie – w 2014 roku – do utworzenia Stowarzyszenia.
Celem organizacji jest rozwój muzeów uczelnianych oraz ochrona i promocja dziedzictwa akademickiego. Działania obejmują m.in. organizację konferencji naukowych, realizację projektów badawczych i edukacyjnych, publikacje oraz współpracę krajową i międzynarodową.
Stowarzyszenie integruje środowisko muzeów uczelnianych w Polsce, wspiera wymianę doświadczeń oraz popularyzuje znaczenie kolekcji akademickich jako ważnego elementu nauki, kultury i edukacji.